Rozliczenie zwrotu kosztów szkolenia pracownika

Firma zewnętrzna przeszkoliła pracownika w zakresie obsługi wózków widłowych. Jednak po pewnym czasie zwolnił się i zgodnie z regulaminem musi nam zwrócić kwotę szkoleń. Czy mam wystawić fakturę ze stawką podstawową, czy skorzystać ze zwolnienie określonego w ustawie o VAT art. 43 ust. 29a? Czy mam wystawić notę księgową?