Wyrok WSA w Warszawie z dnia 22 maja 2024 r., sygn. III SA/Wa 646/24

Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący sędzia WSA Jacek Kaute (sprawozdawca), Sędziowie sędzia WSA Agnieszka Baran, asesor WSA Tomasz Grzybowski, Protokolant sekretarz sądowy Agnieszka Dominiak, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 22 maja 2024 r. sprawy ze skargi O. sp. z o.o. z siedzibą w W. na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w W. z dnia [...] stycznia 2024 r. nr [...] w przedmiocie odmowy określenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych 1) uchyla zaskarżoną decyzję, 2) zasądza od Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w W. na rzecz O. sp. z o.o. z siedzibą w W. kwotę 84.195 zł (słownie: osiemdziesiąt cztery tysiące sto dziewięćdziesiąt pięć złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.

Uzasadnienie

W dniu 7 czerwca 2023 roku do Naczelnika Urzędu Skarbowego W. wpłynął "wniosek o zwrot nadpłaty wraz z oprocentowaniem w podatku od czynności cywilnoprawnych" złożony przez O. sp. z o.o. z siedzibą w W. (Skarżąca, Strona, Spółka), w którym na podstawie art. 75 § 2 w zw. z art. 72 § 1 pkt 1 w zw. z art. 78 § 1 i § 3 pkt 1 w zw. z art. 78a ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2021 r., poz. 1540 ze zm., dalej także "O.p.") Strona wniosła o zwrot na rachunek bankowy kwoty odpowiadającej brakującej części nadpłaty wraz z oprocentowaniem od tej części, a także kwoty oprocentowania niezwróconego na dzień 16 sierpnia 2022 roku. Wniosek ten dotyczył czynności cywilnoprawnej dokonanej 31 marca 2021 roku.

W wyniku umowy sprzedaży zawartej 31 marca 2021 roku Strona nabyła zorganizowaną część przedsiębiorstwa, którą stanowił Pion Infrastruktury spółki P. sp. z o.o. Z tytułu tej transakcji 14 kwietnia 2021 roku Skarżąca złożyła deklarację w sprawie podatku od czynności cywilnoprawnych PCC-3, w której wykazano:

- podatek w kwocie 56 529 160 zł wyliczony od składników majątkowych (umowa sprzedaży), opodatkowanych wg stawki 1% o wartości 5 652 915 983 zł,