Rodzaj, wysokość i ewidencja potrącenia kar za nieterminową realizację zamówienia

W umowie między jednostką budżetową a dostawcą opału jest zawarty zapis, że za nieterminowe wykonanie umowy wykonawca zapłaci zamawiającemu karę umowną w wysokości 1% wartości netto od niezrealizowanego zamówienia, licząc za każdy dzień zwłoki, jednak nie więcej niż 30%. Dostawa miała nastąpić 3 października 2013 r. Za jaki okres należy naliczyć karę umowną, jeżeli dostawa nastąpiła 9 października 2013 r., za 6 dni, tj. od 4 do 9 października 2013 r., czy za 5 dni, czyli nie licząc już dnia, w którym zostanie dostarczony towar? Czy jednostka może o naliczoną karę pomniejszyć przelew do wykonawcy, a kwotę stanowiącą karę odprowadzić do budżetu? Czy w takiej sytuacji fakturę do zapłaty należy opisać w pełnej kwocie, czy w kwocie po potrąceniu kary (opał księgowany jest na magazyn)? Jak prawidłowo zaksięgować opisane zdarzenia?