Potrącenie bez faktury

Pytanie

Podpisałem z wykonawcą umowę na podwykonawstwo inwestycji, których przedmiotem było wybudowanie budynku produkcyjno-magazynowego. Z treści umowy wynika, że zamawiający obciąży wykonawcę kosztami wody, energii elektrycznej, ochrony budowy, dzierżawy zaplecza i WC w wysokości 1% wynagrodzenia umownego. Należności wynikające z tego tytułu zostaną potrącone z każdej faktury wykonawcy, zaś rachunki zamawiającego na powyższe kwoty zostaną wystawione w terminie 7 dni od daty wpływu faktury wykonawcy. Zamawiający, zgodnie z postanowieniami umów, dokonał potrącenia z wynagrodzenia, nie wystawiając faktur na kwotę potrąceń. Czy bez faktur VAT potrącone przez zamawiającego z należnego wynagrodzenia kwoty mogą stanowić koszty uzyskania przychodów?