Czy zakres przedmiotowy umowy musi pozostać w zgodzie z SIWZ i ofertą wykonawcy

W dwóch postępowaniach o zamówienie publiczne postanowienia umów są niezgodne z zobowiązaniami wykonawców, które były w ofertach (m.in. dotyczy to terminów wykonania robót). Doszło do różnic pomiędzy umowami a SIWZ i ofertami wykonawców. Czy faktycznie są to naruszenia, jeżeli umowy to kwestia ustaleń stron (swoboda zawierania umów)? Jakie ewentualnie przepisy naruszono?

W omawianym zakresie na szczególną uwagę zasługują dwie regulacje ustawy z 29 stycznia 2004 r. - Prawo zamówień publicznych (dalej: upzp): art. 82 ust. 3 oraz art. 140 ust. 1.