Jak rozliczyć zobowiązania podatkowe w związku z wynajęciem budynku

PROBLEM

Firma przenosi się do wynajmowanego budynku, który musi przystosować w wyposażeniu do własnych potrzeb. Koszty to wyposażenie magazynów w regały oraz komory chłodnicze oraz biur w komputery, biurka itp. Wynajmującym jest osoba prawna prowadząca działalność gospodarcza zgodnie z umową "zwróci nam koszty przeprowadzki w kwocie..." Kwota zwrotu będzie wyższa niż nasze poniesione koszty wyposażenia. Czy do takiej otrzymanej kwoty wystawia się fakturę wraz z doliczonym VAT? Czy taki przychód jest przychodem podatkowym w dniu wystawienia faktury? Czy koszty zaliczone w dacie poniesienia są kosztem podatkowym? Czy pozostała amortyzacja środków trwałych jest w pełni kosztem w dniu wystawienia faktury za zwrot kosztów?