Wyrok WSA w Warszawie z dnia 13 grudnia 2024 r., sygn. III SA/Wa 2117/24

Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący sędzia WSA Maciej Kurasz, Sędziowie sędzia WSA Ewa Izabela Fiedorowicz, sędzia WSA Jacek Kaute (sprawozdawca), po rozpoznaniu w trybie uproszczonym w dniu 13 grudnia 2024 r. sprawy ze skargi M. sp. z o.o. z siedzibą w Z. na postanowienie Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w W. z dnia [...] lipca 2024 r. nr [...] w przedmiocie odmowy wszczęcia postepowania w sprawie stwierdzenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych oddala skargę.

Uzasadnienie

Spółka M. Sp. z o.o. (dalej także jako Skarżąca, Strona lub Wnioskodawca), pismem z 5 marca 2024 r., działając poprzez pełnomocnika, wystąpiła w trybie art. 75 § 2 O.p. z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych w wysokości 2.924.737,00 zł dot. czynności nabycia przedsiębiorstw aktem notarialnym Rep. A nr [...] z 28 lutego 2020 r. oraz nieruchomości aktem notarialnym Rep. A nr [...] z 28 lutego 2020 r. Do wniosku dołączyła korektę deklaracji w sprawie podatku od czynności cywilnoprawnych oraz kalkulacja zawierająca wykaz nabytych aktywów, obliczoną wartość firmy i podatku od czynności cywilnoprawnych. W uzasadnieniu, pełnomocnik Spółki zaznaczył, że w ramach nabycia przedsiębiorstw podstawę opodatkowania, poza rzeczami i prawami majątkowymi, stanowiła także dodatnia wartość nabytej firmy w wysokości 292.473.729,00 zł. Wartość ta została opodatkowana według stawki 1%, czyli jak od innych praw majątkowych (art. 7 ust. 1 pkt 1 lit. b) ustawy z dnia 9 września 2000 r. o podatku od czynności cywilnoprawnych (Dz. U. z 2024 r. poz. 295, dalej: u.p.c.c.). Zatem zapłacony podatek od dodatniej wartości firmy który wyniósł 2.924.737,00 zł i jest podatkiem nienależnym. Pełnomocnik podkreślił, że "(...) Naczelny Sąd Administracyjny 21 lutego 2022 r. podjął w składzie siedmiu sędziów uchwałę, zgodnie z którą "Dodatnia wartość firmy (tzw. goodwill), rozumiana jako nadwyżka ceny nabycia nad wartością rynkową składników majątkowych przedsiębiorstwa lub jego zorganizowanej części, nie stanowi prawa majątkowego w rozumieniu art. 1 ust. 1 pkt 1 lit. a ustawy z dnia 9 września 2000 r. o podatku od czynności cywilnoprawnych" (sygn. akt III FPS 2/21)".