Kiedy można ustalić preproporcję inną metodą niż wskazana w rozporządzeniu

Jesteśmy samorządową jednostką budżetową. Prowadzimy działalność opodatkowaną, zwolnioną i niepodlegającą VAT. Czy ustalając preproporcję, możemy zastosować metodę inną niż wskazana przez Ministra Finansów?