Czy należy opodatkować brakujące towary w magazynie konsygnacyjnym

Polska firma produkcyjna prowadzi magazyn konsygnacyjny dla niemieckiego dostawcy narzędzi. Z magazynu pobiera, w miarę potrzeb, narzędzia potrzebne do produkcji. W trakcie niedawnej inwentaryzacji magazynu stwierdzono brak kilku narzędzi. Czy w tej sytuacji polska firma jest zobowiązana do naliczenia VAT?