Czy potrącenie przez nabywcę należności z faktury o kaucję wpływa na rozliczenie VAT od usługi budowlanej

Świadczymy usługi budowlane. W czerwcu wystawiliśmy fakturę, którą kontrahent opłacił o kwotę niższą o kaucję (5% kwoty netto faktury), która zostanie zwrócona za pół roku (o ile nie będzie usterek). Czy fakturę potraktować jako opłaconą w całości czy tylko w części faktycznie zapłaconej przez kontrahenta?