Czy można zaliczyć do kosztów VAT płacony w innych krajach UE

Nasza spółka świadczy usługi transportowe na terytorium UE. Jest zarejestrowana jako czynny podatnik VAT i zgłoszona do VAT-UE. Otrzymujemy faktury zakupowe dotyczące m.in. zakupu paliwa, opłat za przejazdy autostradami i parkingi. Na fakturach jest naliczony zagraniczny VAT według stawek obowiązujących w danym państwie UE. Jak ująć takie faktury w kosztach podatkowych? W kwotach brutto czy netto?