Czy zwrot nadpłaty podatku z oprocentowaniem wymaga wniosku podatnika

Sprawa dot. opodatkowania wiatraków za 2017 r. Na wstępie zaznaczyć należy, że z wniosku Spółki była wydana interpretacja indywidualna dot. opodatkowania budowli wg wartości początkowej, zostało to podtrzymane przez SKO, WSA i NSA. Chwilę przed przedawnieniem zobowiązania za 2017 r., Spółka zwróciła się z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty w kwocie 1 130 000 zł, załączając operat (wycenę rynkową) i powołując się na jednolitą linię orzeczniczą NSA. Wydaliśmy decyzję odmawiającą stwierdzenia nadpłaty, powołując się na fakt wydania w tej sprawie już orzeczeń WSA i NSA. SKO utrzymało w mocy decyzję, WSA też, a NSA zwróciło do SKO zarzucając im, że jest to odrębne postępowanie i nie można opierać się na tych orzeczeniach. SKO zwróciło nam sprawę do ponownego rozpatrzenia. Stwierdziliśmy, że faktycznie linia orzecznicza wskazuje na opodatkowanie wg. wartości rynkowej. Przeanalizowaliśmy operat Spółki, uznaliśmy, że zaniżyli wartość rynkową budowli. Powołaliśmy swojego biegłego do sporządzenia operatu (wyceny rynkowej). Wartość się znaczenie różniła – podatnik w operacie wskazał wartość rynkową wg metody dochodowej. Nasza biegła wskazała, że wartość budowli powinna być określona wg metody odtworzeniowej, w tej sprawie pojawiły się też wyroki NSA. W konsekwencji wydaliśmy decyzję uznającą część nadpłaty. Spółka się odwołała od decyzji, ale tylko w zakresie odmówionej części nadpłaty. Obecnie musimy zwrócić tę nadpłatę wynikającą z decyzji. I tu się rodzi pytanie, czy powinniśmy zwrócić ją z oprocentowaniem? Postępowanie trwało prawie 3 lata, ale ze względu na opieszałość innych organów. Jeśli konieczne jest oprocentowanie nadpłaty, czy powinniśmy zwrócić ją z nadpłatą, czy podatnik powinien wystąpić z wnioskiem o oprocentowanie nadpłaty?