Jak rozliczyć VAT z faktury zaliczkowej

We wrześniu otrzymałam fakturę zaliczkową kosztową na 5000 zł brutto, nie zaksięgowałam jej. W październiku otrzymałam fakturę końcową do zaliczki z września na kwotę całkowitą 10 000 zł brutto. Czy mogę odliczyć całkowity VAT (od 10 000 zł) w październiku z faktury końcowej, czy powinnam z faktury zaliczkowej odliczyć część i z końcowej różnicę?