Czy naliczać VAT przy nabyciu towaru ze składu celnego

Jesteśmy zarejestrowanym podatnikiem VAT UE w Polsce. Sprowadzamy towar ze składu celnego w Czechach od zarejestrowanego tam podatnika VAT UE. Cło i podatek VAT płacimy i odliczamy na podstawie dokumentu SAD. Czy powinniśmy również naliczyć i odliczyć VAT jeszcze raz (podwójne opodatkowanie) ze względu na WNT (wewnątrzwspólnotowe nabycie towarów), a jeśli tak - to co jest podstawą opodatkowania?