Wyrok NSA z dnia 21 czerwca 2002 r., sygn. I SA/Lu 1428/01

Do weryfikacji merytorycznej prawidłowości samoobliczenia podatku nie służą czynności sprawdzające lecz postępowanie podatkowe kończące się - jeśli kwota zwrotu różnicy podatku jest inna niż wykazana w deklaracji złożonej przez podatnika - wydaniem decyzji określającej prawidłową kwotę zwrotu lub nawet zobowiązania podatkowego, zgodnie z przepisami prawa podatkowego. Wcześniejsze podjęcie czynności sprawdzających, a także wydanie postanowienia o zarachowaniu wykazanej kwoty zwrotu różnicy podatku VAT na poczet innego zobowiązania podatkowego, nie stoi na przeszkodzie późniejszemu wszczęciu postępowania podatkowego.