Zwrot nienależnie pobranych świadczeń

Mam problem z rozliczeniem nadpłaty wynagrodzenia za lata ubiegłe. Pracownik wyraził zgodę na potrącenie z jego wynagrodzenia w ratach nadpłaconej należności za poprzednie lata. Zgodnie z opinią miejscowego urzędu skarbowego: „gdy podatnikowi zostały wypłacone świadczenia nienależne, które uprzednio zwiększały jego dochód do opodatkowania i od których płatnik pobrał zaliczkę na podatek dochodowy, podatnik dokonuje zwrotu tych świadczeń (fizycznego zwrotu do kasy), w wysokości faktycznie otrzymanej, czyli w wartości netto. Płatnik natomiast przy ustalaniu wysokości podatku (zaliczki) od kolejnych dochodów, uzyskanych przez podatnika, uwzględnia kwotę zwrotu i od dochodu do opodatkowania odejmuje zwróconą przez podatnika kwotę wraz z odprowadzoną nienależnie zaliczką i składką na ubezpieczenie zdrowotne”. Czy naliczoną zaliczkę na podatek dochodowy od nadpłaconego wynagrodzenia zwracanego w ratach można odliczyć jednorazowo z bieżących wpłat, czy należy wyliczyć ją adekwatnie do potrącanych rat netto i dokonywać odliczeń od wpłat w okresach miesięcznych?