Czy dopłata od gminy dla firmy prowadzącej przewozy lokalne jest opodatkowana VAT

Spółka, w której 100% udziałowcem jest gmina, organizuje lokalny transport ludności. Na podstawie uchwały rady gminy co miesiąc spółka otrzymuje dopłatę w wielkości uzależnionej od ilości przejechanych przez jej autobusy kilometrów. Gmina otrzymuje na tej podstawie fakturę, na której widnieje pozycja "dopłata - uchwała rady gminy 26/2011". Wykazany jest także podatek należny. Jako skarbnik gminy uważam, że wypłacanej przez gminę dopłaty nie powinniśmy traktować jako usługi ani innej czynności opodatkowanej VAT, tym samym spółka w ogóle nie powinna wystawiać w takim przypadku faktury. Czy moje wątpliwości są uzasadnione?