Wyrok WSA w Olsztynie z dnia 22 kwietnia 2026 r., sygn. I SA/Ol 96/26

Wojewódzki Sąd Administracyjny w Olsztynie w składzie następującym: Przewodniczący sędzia WSA Przemysław Krzykowski, Sędziowie sędzia WSA Katarzyna Matczak, sędzia WSA Jolanta Strumiłło (sprawozdawca), Protokolant sekretarz sądowy Weronika Ćwiek, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 22 kwietnia 2026 r. sprawy ze skargi C. Spółki Akcyjnej z siedzibą w B. na decyzję Naczelnika Warmińsko-Mazurskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Olsztynie z dnia 30 listopada 2022 r., nr 378000-COP.4100.3.2022.SK.SZD w przedmiocie określenia wysokości zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób prawnych za 2014 r. I. uchyla zaskarżoną decyzję; II. zasądza od Naczelnika Warmińsko-Mazurskiego Urzędu Celno – Skarbowego w Olsztynie na rzecz C. Spółki Akcyjnej z siedzibą w B. kwotę 25 879 (dwadzieścia pięć tysięcy osiemset siedemdziesiąt dziewięć) złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.

Uzasadnienie

C. Spółka Akcyjna z siedzibą w B. (dalej jako strona, Spółka, podatnik, skarżąca) wniosła do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego (dalej jako WSA) w Olsztynie skargę na decyzję Naczelnika Warmińsko-Mazurskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Olsztynie (dalej jako Naczelnik UCS, NUCS) z 30 listopada 2022 r. w przedmiocie określenia wysokości zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób prawnych za 2014 r.

Rozpoznana sprawa była już przedmiotem orzekania. Naczelny Sąd Administracyjny wyrokiem z 21 stycznia 2026 r., II FSK 1481/23, uchylił w całości wyrok WSA w Olsztynie z 5 kwietnia 2023 r., I SA/Ol 77/23, i przekazał sprawę do ponownego rozpoznania temu Sądowi.

Opisując stan faktyczny sprawy przypomnieć należy, że decyzją z 30 listopada 2022 r. Naczelnik UCS utrzymał w mocy własną decyzję z 4 maja 2021 r. określającą Spółce zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym od osób prawnych (dalej jako podatek CIT) za 2014 r. w kwocie 1.504.456,00 zł. W uzasadnieniu zaskarżonej do Sądu decyzji organ podatkowy w pierwszej kolejności stwierdził, że zostały w sprawie spełnione wszystkie przesłanki zawieszenia biegu terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego w podatku CIT za 2014 r. wynikające z art. 70 § 6 pkt 1 w związku z art. 70c ustawy z 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2021 r. poz. 1540, ze zm.), dalej jako "O.p.". NUCS uwzględnił przy tym treść uchwały Naczelnego Sądu Administracyjnego z 18 czerwca 2018 r., I FPS 1/18, stwierdzając, że postępowanie karne-skarbowe nie zostało wszczęte w sposób instrumentalny, tj. w celu zawieszenia biegu terminu przedawnienia.