Zgodnie z art. 206 i 207 ustawy z 23 stycznia 2003 r. o powszechnym ubezpieczeniu w Narodowym Funduszu Zdrowia (Dz.U. Nr 45, poz. 391) z dniem wejścia w życie ustawy, tj. z dniem 1 kwietnia 2003 r., regionalne kasy chorych przekształcają się w oddziały wojewódzkie Funduszu, natomiast centrala Branżowej Kasy Chorych dla Służb Mundurowych wchodzi w skład centrali Funduszu, a oddziały terenowe Branżowej Kasy Chorych dla Służb Mundurowych wchodzą w skład właściwych oddziałów wojewódzkich Funduszu.