Czy można odliczyć VAT z faktury dokumentującej przedawnione zobowiązanie

Od wielu lat współpracuję z jednym ze składów budowlanych. Każdego miesiąca dostarczają mi towary przynajmniej kilka razy. Przez błędne działanie systemu komputerowego od kilku lat przy niektórych dostawach uzyskiwałem więcej towaru, niż zamawiałem. Obecnie otrzymałem korekty faktur i m.in. ze względu na chęć zachowania dobrej współpracy opłaciłem wszystkie wynikające z tego powodu zaległości (łącznie kilkanaście tysięcy złotych). Część z opłaconych zobowiązań była na gruncie prawa cywilnego już przedawniona. Czy wpływa to na moje prawo do odliczenia VAT w takim przypadku?