Wyrok WSA w Gdańsku z dnia 3 grudnia 2025 r., sygn. I SA/Gd 758/25

Wojewódzki Sąd Administracyjny w Gdańsku w składzie następującym: Przewodniczący: Sędzia NSA Małgorzata Gorzeń Sędziowie: Sędzia NSA Elżbieta Rischka Sędzia WSA Irena Wesołowska (spr.) po rozpoznaniu w Wydziale I w trybie uproszczonym w dniu 3 grudnia 2025 r. sprawy ze skargi A. Sp. z o.o. z siedzibą w W. na postanowienie Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Gdańsku z dnia 13 sierpnia 2025r., nr 2201-IER.7010.17.2025 w przedmiocie odmowy zaliczenia nadpłaty w podatku dochodowym od osób prawnych za 2020 rok oddala skargę

Uzasadnienie

Decyzją z dnia 16 września 2024 roku Naczelnik Urzędu Skarbowego w Malborku (dalej: Naczelnik) określił A. Sp. z o.o. z siedzibą w W. (dalej: Skarżąca) wysokość podatku dochodowego od osób prawnych za 2020 rok w wysokości 72 039,00 zł.

Decyzją z dnia 23 kwietnia 2025 r. Dyrektor Izby Administracji Skarbowej w Gdańsku (dalej: Dyrektor) uchylił decyzję Naczelnika i przekazał sprawę do ponownego rozpatrzenia przez organ pierwszej instancji.

Skarżąca w dniu 30 kwietnia 2025 roku złożyła wniosek (skorygowany w dniu 8 maja 2025 r.) o zaliczenie nadpłaty w podatku od osób prawnych CIT za 2020 rok w kwocie 26 929,94zł na poczet podatku od towarów i usług za I kwartał 2025 r.

Naczelnik w dniu 22 maja 2025 roku wydał postanowienie, którym odmówił Stronie zaliczenia nadpłaty z CIT za 2020 rok na poczet VAT za I kwartał 2025 r. Odmowę uzasadniono koniecznością zakończenia postępowania, co wiąże się z wydaniem nowej decyzji i ustaleniem kwoty ewentualnej nadpłaty.

Na skutek złożenia zażalenia Dyrektor postanowieniem z dnia 13 sierpnia 2025 r. utrzymał w mocy rozstrzygnięcie organu pierwszej instancji.

W uzasadnieniu Dyrektor wskazał, że zgodnie z art. 76 § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2025 r., poz. 111 ze zm. – dalej: O.p.) nadpłaty wraz z ich oprocentowaniem podlegają zaliczeniu z urzędu na poczet zaległości podatkowych wraz z odsetkami za zwłokę, odsetek za zwłokę od nieuregulowanych w terminie zaliczek na podatek, kosztów upomnienia oraz bieżących zobowiązań podatkowych, a w razie ich braku podlegają zwrotowi z urzędu, chyba że podatnik złoży wniosek o zaliczenie nadpłaty w całości lub w części na poczet przyszłych zobowiązań podatkowych. Przy czym dla rozstrzygnięcia niniejszej sprawy istotne znaczenie ma brzmienie art. 77 § 4 O.p. w myśl, którego "w przypadku niewydania nowej decyzji w terminie 3 miesięcy od dnia uchylenia albo stwierdzenia nieważności przez organ podatkowy lub od dnia doręczenia organowi podatkowemu odpisu orzeczenia sądu administracyjnego ze stwierdzeniem jego prawomocności, uchylającego decyzję albo stwierdzającego jej nieważność, nadpłata stanowiąca kwotę wpłaconą na podstawie decyzji uchylonej albo decyzji, której nieważność stwierdzono, podlega zwrotowi bez zbędnej zwłoki".