Jak opodatkować sprzedaż nakładów inwestycyjnych

Wydzierżawiliśmy lokale handlowe spółce, która na własny koszt wyremontowała te lokale. Po rozwiązaniu umowy zażądała zwrotu nakładów. Doszliśmy do porozumienia i zwrócimy im poniesione nakłady. Jak powinniśmy postąpić w tym przypadku?