Jak rozliczać godziny nadliczbowe pracownikowi wykonującemu pracę w równoważnym systemie czasu pracy

Mam pytanie odnośnie rozliczania godzin nadliczbowych w równoważnym systemie czasu pracy. Czy pracownikowi trzeba naliczać godzinowe wynagrodzenie dodatkowe za liczbę przepracowanych godzin nadliczbowych i dodatek za pracę w godzinach nadliczbowych, czy sam dodatek? Pytam, ponieważ niedawno klient, którego obsługuję wprowadził taki system pracy, a system ERP Optima, na którym pracuję nalicza tylko dodatek 100% lub 50% i nie wiem, czy powinno zmienić się ustawienia w ERP Optima.