Czy wycofanie z działalności budynku podlega opodatkowaniu VAT

Podatnik będący osobą fizyczną prowadzącą działalność gospodarczą wybudował budynek (pięć mieszkań na wynajem i pawilon handlowy). Podatnik odliczył VAT od części handlowej i obecnie zamierza wycofać przedmiotowy budynek z działalności gospodarczej. Od budowy budynku minęło 6 lat. Czy dochodzi do opodatkowania VAT? Jeśli tak, co stanowi podstawę opodatkowania? Czy należy wystawić fakturę wewnętrzną?