Obciążenie pracownika kosztami szkolenia - konsekwencje podatkowe w VAT

Firma zewnętrzna przeszkoliła pracownika z w zakresie obsługi wózków widłowych. Jednak po pewnym czasie pracownik zwolnił się i zgodnie z regulaminem musi nam zwrócić kwotę szkoleń. Czy mam wystawić fakturę ze stawką podstawową, czy skorzystać ze zwolnienia określonego w ustawie o VAT art. 43 ust. 29 a? Czy mam wystawić notę księgową?