Jak udokumentować wynajem lokalu użytkowego przez podatnika świadczącego zwolnione od podatku usługi medyczne

Podnajmuję od marca br., w stałych dniach tygodnia, gabinet lekarski od innego lekarza, który wynajmuje ten lokal od kilku lat od Wojskowej Agencji Mieszkaniowej. Agencja wyraziła zgodę na podnajem m.in. pod warunkiem, że czynsz pobierany za podnajem nie będzie wyższy od czynszu, jaki płaci wynajmujący do WAM. W umowie podnajmu ustalono, że będzie to 50% wysokości czynszu. Lekarz wynajmujący gabinet nie prowadzi innej działalności niż usługi medyczne (zwolnione od podatku VAT). Czy za dowód opłacenia czynszu powinna zostać wystawiona faktura VAT, czy też może rachunek, wystawiany na podstawie ordynacji podatkowej? Czy powinien to być rachunek „z gabinetu” czy też rachunek od osoby fizycznej?