Jak opodatkować podnajem mieszkania pracownikom

Firma podnajmuje swojemu pracownikowi część wynajmowanego przez nią lokalu mieszkalnego; w akcie założycielskim spółki w zakresie działalności jest zapis „wynajem nieruchomości na własny rachunek”. Czy podnajem części lokalu pracownikowi podlega opodatkowaniu VAT i czy należy wystawić fakturę VAT? Firma za najem od osoby fizycznej otrzymuje rachunki.