Kto wystawia fakturę za zaliczkę otrzymaną przez podmiot trzeci

Przelaliśmy zaliczkę na rachunek bankowy wskazany nam przez kontrahenta. Taki rachunek nasz kontrahent wskazał w umowie, którą zawarliśmy na wykonanie określonych prac. Rachunek bankowy nie należy do kontrahenta, tylko do podmiotu trzeciego, który jest z kolei podwykonawcą naszego kontrahenta. Kto w takiej sytuacji powinien wystawić fakturę za otrzymaną zaliczkę i kiedy możemy odliczyć VAT z tej faktury?