Potrącenie czy odliczenie z wynagrodzenia?

W listopadzie w wyniku błędu księgowego na rachunek bankowy jednego z pracowników przelano wynagrodzenie wraz z nienależną mu premią. W grudniu doszliśmy z pracownikiem do porozumienia na temat rozwiązania stosunku pracy z końcem miesiąca, jednak twierdzi on, że otrzymał wypłatę w prawidłowej wysokości, gdyż premia mu się należała. Czy mogę odliczyć nadpłaconą kwotę z należnej pracownikowi odprawy i ekwiwalentu za urlop?