Współpraca z biurem rachunkowym po wejściu KSeF – co powinien zawierać aneks do umowy
Wprowadzenie obowiązkowego KSeF zmieniło nie tylko techniczny sposób wystawiania faktur, ale również organizację współpracy między klientem a biurem rachunkowym. Szczególne znaczenie mają klauzule regulujące sposób przekazywania danych, proces akceptacji faktur sprzedażowych i zakupowych oraz podział odpowiedzialności między stronami, a także postanowienia dotyczące działania w sytuacjach awaryjnych, w tym przy stosowaniu trybu offline24.

Faktura ustrukturyzowana jest uznawana za wystawioną z chwilą przesłania jej do KSeF, co sprawia, że wysyłka dokumentu staje się czynnością wywołującą skutki podatkowe. W efekcie dotychczasowe umowy o obsługę księgową często nie odpowiadają nowym realiom. Aneks powinien precyzyjnie określać zakres obowiązków i odpowiedzialności stron, zasady korzystania z uprawnień w systemie oraz procedury postępowania w sytuacjach awaryjnych.
Wyjaśniamy, jakie zapisy powinny znaleźć się w aneksie, z podziałem na trzy obszary:
1. odpowiedzialność za dane i zakres czynności,
2. uprawnienia w systemie oraz akceptacja faktur,
3. postępowanie w razie awarii KSeF.
Zakres czynności biura i odpowiedzialność za dane
Aneks musi rozróżniać, czy biuro jedynie księguje faktury pobrane z KSeF, czy również je wystawia i wysyła w imieniu klienta. Od tego zależy zakres odpowiedzialności. Zapisy w tym zakresie powinny obejmować:
- Zakres czynności biura – aneks musi jednoznacznie wymieniać, które czynności biuro wykonuje w KSeF: wystawianie faktur, wysyłkę do systemu, pobieranie faktur od kontrahentów, weryfikację formalną dokumentów, księgowanie oraz archiwizację UPO i numerów KSeF. Biuro wystawiające i wysyłające faktury ponosi bowiem inne ryzyko niż biuro, które jedynie je księguje. Jeśli aneks tego nie rozróżnia, zakres odpowiedzialności biura może zostać rozszerzony wbrew intencji stron.
- Odpowiedzialność za dane do faktury – biuro nie jest stroną transakcji i działa wyłącznie na podstawie informacji otrzymanych od klienta. Może sprawdzić, czy faktura jest formalnie kompletna, ale nie ocenia, czy stawka VAT odpowiada klasyfikacji świadczenia ani czy cena odpowiada umowie z kontrahentem. Aneks powinien wprost przesądzać, że klient odpowiada za prawidłowość i kompletność wszystkich przekazanych danych, czyli: nabywcy, przedmiotu sprzedaży, podstawy opodatkowania, stawki VAT, kwoty podatku, dat i warunków płatności.
- Zlecenie wystawienia faktury – przekazanie kompletnych danych powinno stanowić zlecenie wystawienia faktury i jej przesłania do KSeF. Eliminuje to wątpliwość, czy biuro potrzebuje dodatkowego zatwierdzenia klienta przed wysyłką.
- Terminy przekazywania danych – terminy realizacji należy liczyć od momentu wpłynięcia kompletnych i prawidłowych danych, a nie od złożenia zlecenia. Biuro nie ponosi odpowiedzialności za opóźnienie ani za konieczność korekty wynikającą z danych przekazanych przez klienta z opóźnieniem lub błędnie.
Uprawnienia w KSeF i procedura akceptacji faktur
Ministerstwo Finansów potwierdziło, że można nadać biuru samo uprawnienie do wystawiania faktur bez dostępu do ich przeglądania:
- Nadanie i utrzymanie uprawnień w KSeF – biuro może działać w KSeF wyłącznie w granicach uprawnień nadanych przez klienta. Ministerstwo Finansów potwierdziło, że można nadać biuru samo uprawnienie do wystawiania faktur bez dostępu do ich przeglądania. Aneks powinien zobowiązać klienta do nadania, utrzymywania i aktualizowania uprawnień przez cały czas trwania umowy oraz wprost zwalniać biuro z odpowiedzialności za niewykonanie usługi z powodu braku, cofnięcia lub ograniczenia tych uprawnień. Bez tego zapisu biuro może odpowiadać za opóźnienie, którego źródłem jest wyłącznie zaniechanie klienta.
- Procedura akceptacji faktur przed wysyłką – jeśli klient chce zachować kontrolę nad określonymi fakturami (np. korektami, zaliczkami, fakturami ponad ustalony limit), aneks powinien to wyraźnie określać, wraz z terminem zatwierdzenia i skutkiem jego przekroczenia. Biuro nie powinno automatycznie przyjmować odpowiedzialności za merytoryczną ocenę transakcji ani za zastosowanie określonej stawki VAT, jeżeli nie wynika to wyraźnie z zakresu umowy.
- Osoby uprawnione do kontaktu – klient powinien wskazać w aneksie osoby upoważnione do zlecania wystawienia faktur, zatwierdzania dokumentów i podejmowania decyzji w sytuacjach awaryjnych. Jeśli biuro może otrzymywać dyspozycje od dowolnego pracownika klienta, ryzyko błędów i sporów rośnie.
Awaria KSeF, systemy zewnętrzne i archiwizacja
Za awarię publicznego systemu teleinformatycznego żadna ze stron nie odpowiada, jednak musi to z aneksu wprost wynikać:
- Procedura awaryjna i offline – Ministerstwo Finansów przewiduje dwa tryby działania poza KSeF. W razie awarii ogłoszonej w Biuletynie Informacji Publicznej fakturę wystawioną w trybie awaryjnym należy dosłać do systemu w ciągu 7 dni roboczych od jej zakończenia. W przypadku tzw. całkowitej awarii faktur nie dosyła się w ogóle. Aneks powinien określać: kto monitoruje komunikaty Ministerstwa Finansów i decyduje o zastosowaniu właściwego trybu awaryjnego, w jaki sposób faktura trafia do nabywcy poza KSeF, kto dostarcza biuru dane do późniejszego dosłania faktury.
- Wyłączenie odpowiedzialności za systemy zewnętrzne – biuro powinno być wprost zwolnione z odpowiedzialności za skutki awarii KSeF, niedostępności systemów Ministerstwa Finansów, błędów oprogramowania zewnętrznego i problemów z systemami informatycznymi klienta. Biuro odpowiada za należytą staranność przy wykonaniu powierzonych czynności, a nie za to, czy publiczny system teleinformatyczny działa.
- Archiwizacja UPO i numerów KSeF – aneks powinien określać, czy biuro ma obowiązek pobierać i przechowywać potwierdzenia wysyłki, czy tylko udostępniać je na żądanie klienta, z określeniem terminu i formy przechowywania. Dowód przesłania faktury do KSeF i nadania jej numeru może mieć znaczenie przy ustalaniu, czy faktura została skutecznie wystawiona i kiedy nastąpiło jej otrzymanie przez nabywcę.
- Zasady korekt faktur – jeśli błąd w fakturze wynika z danych przekazanych przez klienta, klient powinien być zobowiązany do niezwłocznego przekazania danych do korekty. Biuro nie ponosi odpowiedzialności za konieczność korekty faktury wystawionej na podstawie błędnych lub spóźnionych danych.
- art. 106na ustawy z 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (j.t. Dz.U. z 2025 r. poz. 775; ost.zm. Dz.U. z 2026 r. poz. 846)
Rafał Styczyński


